Facteurs climatiques et environnementaux
Après des recherches poussées et de méticuleux travaux de sélection, plusieurs qualités intéressantes comme une meilleure résistance aux maladies, aux ravageurs et au stress sont attribuées aux semences hybrides F1 de lignées pures. Il en est de même pour diverses autres qualités génétiques (croissance précoce, saveur prononcée, relative rusticité, etc.).
Toutefois, les cultivars à pollinisation libre sont aussi des plantes parfaitement adaptées aux conditions climatiques et qui s'avèrent capables de résister à divers nuisibles, surtout lorsque l'horticulteur, l'agriculteur ou le forestier sait s'y prendre. En matière de saveur des fruits, des légumes et des céréales, les plantes issues des semences traditionnelles (celles des variétés pays) conservent fidèlement les qualités des plants mères. Ce qui explique en partie l'attachement de nombreux paysans aux semences ancestrales et le choix des consommateurs (notamment ceux des AMAP) aux produits agricoles traditionnels.